Filtro Medusa tiene sus inicios en el 2001, la idea inicial de Gerardo Pézantes, fundador, y su cofundador Juan Arciria, guitarrista, los miembros mas antiguos de la banda, fue la de crear una simbiosis musical con respecto a las corrientes del Rock fuerte y Alternativo, para esa tarea contaron con la participación en sus principios de Wilson Rodríguez en la batería, quien posteriormente fue remplazado por Franz Morales y luego por David Quintero, baterista oficial que debutó en la producción debut del grupo grabado en PTY Studios y producido por Ignacio Molino, y también grabó los temas que formaron parte del disco PanamaRock Nuevas Bandas 2006 en los prestigiosos Insomnio Studios bajo la producción de Juan Carlos García de Paredes y Pablo Quintero, el cual contiene “El Vicio Perfecto”, en una versión alternativa a la de su disco propio y “Angel Eterno”, el cual fue el tema promocional de la banda para este compacto. Filtro Medusa obtuvieron este derecho al ocupar el 3er. Lugar en el concurso del mismo nombre, realizado a mediados del 2005.  Aleko Cadavid, quien ejecuta el bajo, es uno de los miembros estables del grupo desde sus inicios, Bethy García, el equilibrio musical de la banda, debido a la características especiales de su voz, forma parte de la agrupación desde el 2003.

En diciembre de 2005 la banda vio consagrada su popularidad al ganar el premio a Mejor Banda Alternativa en los Premios PanamaRock de ese año. El 2006 arranca con el lanzamiento de su producción propia simultáneamente con el disco PanamaRock Nuevas Bandas 2006  con el cual se inició la promoción con el tema "Angel Eterno" cuyo video fue dirigido por Francisco Pascual. Para finales del año la banda recibió 4 nominaciones para los Premios PanamaRock 2006 y se convirtió en la primera banda panameña en ser invitada a presentarse en Rock Al Parque, el festival de Rock más grande en Latinoamérica, el cual se realizó en el mes de octubre en Bogotá, Colombia y en donde la banda obtuvo una excelente aceptación por parte de los asistentes. Para el 29 de noviembre, fecha en que se realizaran los Premios PanamaRock 2006, Filtro Medusa obtiene los premios a "Mejor Banda Alternativa", repitiendo la hazaña del año anterior, y se lleva también el importantísimo premio a "Canción del Año" por "Angel Eterno". La banda fue invitada por las Escuelas de Rock de Chile para presentarse en el Festival Rockódromo en Valparaíso el 29 de diciembre, convirtiéndose en la segunda banda panameña en visitar Chile para una presentación.

El 2007 inició con fuerza para Filtro Medusa, lanzando el elaborado videoclip del sencillo "Oscuro Corazón", bajo la dirección de Alberto Serra, el cual lograra colocarse entre los 10 Mas Pedidos Metal en la cadena MTV Latino. Para marzo, la banda fue firmada por la marca internacional Converse. Para abril Filtro Medusa logra históricamente convertirse en la primera banda panameña en llegar al No. 1 de la cadena MTV Latino, al colocar, en el sitio de honor de los 10 + Pedidos Metal, el video de "Oscuro Corazón".

En junio la banda presenta la Edición Especial de su disco debut, la cual fue remasterizada en PTY Studios y se le incluyó el sencillo del disco PanamaRock Nuevas Bandas 2006 "Angel Eterno" y las nuevas versiones de los temas "Oscuro Corazón" y "Abril". Esta edición incluye también, en formato interactivo, los videos musicales de los temas "Angel Eterno" y "Oscuro Corazón", además de una versión en vivo de "Oscuro Corazón", grabada en la presentación de la banda en los Premios PanamaRock 2006.

La cadena MTV Latinoamérica, junto con Vodka Smirnoff, realizan en el 2007 el concurso de bandas "La Zona de Combate", para el mismo el grupo se inscribe y poco después reciben la noticia de que fueron seleccionados como semifinalistas, ganándose así la oportunidad de viajar a la eliminatoria regional en Santo Domingo, República Dominicana, en donde compiten con dos bandas locales y Le Pop de Costa Rica, quienes mas adelante fueron en México D.F. los ganadores del concurso. Aunque no resultaran ganadores, este concurso representó una gran oportunidad para Filtro Medusa, abriéndole aun mas las puertas a nivel internacional.

El 4 de diciembre de 2007 la banda gana por tercera vez consecutiva el premio a la "Mejor Banda Alternativa" y por segunda vez uno de los premios más importantes de la ceremonia anual, el de "Mejor Canción del Año", reafirmando así la popularidad nacional e internacional que obtuvo el tema "Oscuro Corazón".